토지에 관하여 별도 등기가 있을경우....

03-14353을 보다 궁금해서 그러는데 별도 등기 있을경우 낙찰을 받을 경우 추후에 분쟁의 소지가 있나요.있다면 어느쪽이 유리한건지... 관리자 입장으로 생각했을때 낙찰을 받아도 되느지....궁금합니다.